第25集 - 再度交鋒！新幹線戰士對黑色新幹線戰士
隼人前往名古屋探望龍司母親，並從辰巳口中得知龍司放棄空手道的理由。青龍駕駛黑色新幹線直奔大宮超進化研究所，秋田等人半途攔截，但不敵龍騎兵模式。龍司建議將敵人引入研究所的地下試驗場。

第24集 - 入侵！迷你版巨型怪物體
伊邪不許青龍駕駛黑色新幹線戰士出擊，除非他能答到人類進化的原因。上田梓受出水所託拍攝黑色新幹線，手機卻被黑色粒子依附，使之變成微型怪物體，進入超進念研究所盜取數據，眾人發現後合力圍捕。

第23集 - 出動！新幹線戰士500回聲號
隼人一家前往京都探望北斗，但阿遙卻神色有異，原來她懷疑一直在外的北斗有外遇。敵人派出船型的巨型怪物體，更利用捕獲力場無法覆蓋水底的弱點逃遁而去。北斗緊急之下乘上500回音號截擊敵人。

第22集 - 一飛沖天！E5隼號連結800燕號
吞食地幔怪發出高熱，令秋田等三名新幹線戰士無功而還，機體更受損傷。對抗敵人的唯一方法是讓E5和800進行連結合體，讓E5獲得飛行能力。為了幫助隼人克服畏高，眾人帶他去皿倉山玩滑翔傘作為訓練。